A través de su participación de mas 50 años con el desarrollo de la música Afro-Caribe, Johnny Pacheco ha recibido muchos reconocimientos entre ellos:
- En 1996, el presidente de la República Dominicana, Joaquín Balaguer le otorgó la prestigiosa Medalla Presidencial de Honor.
- En 1997, le fue dado el Bobby Capó Lifetime Achievement Award, otorgado por el gobernador de Nueva York, George Pataki.
En noviembre de 1998, fue incluido en el International Latin Music Hall of Fame. Ese mismo año gana el El Soberano en la ceremonia de los Premios Casandra de ese año.
En el mismo año y por su trayectoria musical fue declarado
"Gloria de la música nacional y afro antillana" por el Senado de República Dominicana.
Ha grabado y compuesto más de 150 canciones. Entre ellos se encuentran "La Dicha Mía", "Quítate Tú" (Pa' Ponerme Yo), "Acuyuye", "El Rey de la Puntualidad", "El Numero Cien" y "Celia y Tito".
Johnny Pacheco también fue fuente de inspiración para las generaciones más jóvenes.
El rapero Mangu le preguntó si podia escribir arreglos, coros y tocar la flauta en su álbum "Calle Luna Y Calle Sol".
Pacheco también ha producido musica para peliculas.
Fue director musical de la película, Our Latin Thing "Nuestra Cosa Latina", la primera película sobre la salsa y su influencia en los latinos de Nueva York.
Y en 1974, trabajó en una segunda película titulada SALSA.
Durante la década de los 80's, escribió las partituras y los temas de las películas Mondo New York y Algo salvaje.
La última fue en colaboración con David Byrne, líder del grupo Talking Heads. También trabajó con la película The Mambo Kings lanzada por Warner Brothers.
Pacheco también se ha comprometido con el mejoramiento de la comunidad latina en todo el mundo. Participó en el concierto benéfico contra el sida llamado "Concierto Por La Vida", en noviembre de 1988 en el Avery Fisher Hall de Nueva York. Demostró su solidaridad con las víctimas del huracán Georges colaborando con Hispanic Federation Relief Fund durante el "Hurricane Georges Relief Fund 1998" (huracán Georges Fondo de Ayuda para 1998). Este evento fue transmitido en vivo a través del noreste de Estados Unidos por la cadena de televisión NBC. También participó en un evento en Hostos Community College para el mismo propósito.
Pacheco creó en 1994, el Johnny Pacheco Scholarship Fund (Fondo de Becas Johnny Pacheco.